In questi ultimi anni è stato ampiamente dimostrato e riportato dalla letteratura scientifica che, per scopi medico-legali e antropologici, vi è molto spesso la necessità di utilizzare banche dati di DNA mitocondriale e del NRY(regione non ricombinante sul cromosoma Y) in grado di combinare le informazioni sul genoma con informazioni geografiche. La somma di queste due informazioni consente di individuare le regioni nel mondo dove la frequenza di marcatori, o combinazioni di marcatori identici a quelli cercati (ad esempio in una traccia biologica qualsiasi) è più alta, ovvero di attribuire una o più regioni più probabili come origini del soggetto o della traccia. In particolare i marcatori del cromosoma Y ereditati nella linea paterna consentono la ricostruzione della storia naturale sulla base delle mutazioni via via acquisite. (permettendo di ipotizzare anche il tracciato territoriale o geografico del cammino percorso dai nostri avi) L'identificazione di sotto-aplogruppi (che fanno riferimento alla variazione della regione non ricombinante del cromosoma Y), la definizione della loro distribuzione geografica e la quantificazione della loro variazione interna, possono dare importanti informazioni sui processi migratori antichi e recenti e su eventi demografici che, avendo lasciato tracce nella struttura genetica delle popolazioni moderne, ce ne raccontano la storia. L'applicazione web sviluppata, chiamata Y-nvestigation, permette, tramite la costruzione di apposite banche dati, di raccogliere informazioni di tipo biologico su tale cromosoma, combinare tali informazioni sul genoma con i relativi dati geografici, esplorare quindi la variazione genetica e la distribuzione geografica dei tipi di cromosomi Y tramite la visualizzazione di mappe principalmente dello spazio eurasiatico.

Petricone, D., Novelletto, A., Vigliano, L. (2018). Y-nvestigation: applicazione per analisi geografica della variabilità del cromosoma Y. ??????? it.cilea.surplus.oa.citation.tipologie.CitationProceedings.prensentedAt ??????? FOSS4G-IT 2018 Software e Dati Geografici Free e Open Source, Dipartimento di Scienze dell'Antichità dell'Università di Roma La Sapienza.

Y-nvestigation: applicazione per analisi geografica della variabilità del cromosoma Y

Petricone Davide
;
Novelletto Andrea
;
Vigliano Loredana
2018-02-20

Abstract

In questi ultimi anni è stato ampiamente dimostrato e riportato dalla letteratura scientifica che, per scopi medico-legali e antropologici, vi è molto spesso la necessità di utilizzare banche dati di DNA mitocondriale e del NRY(regione non ricombinante sul cromosoma Y) in grado di combinare le informazioni sul genoma con informazioni geografiche. La somma di queste due informazioni consente di individuare le regioni nel mondo dove la frequenza di marcatori, o combinazioni di marcatori identici a quelli cercati (ad esempio in una traccia biologica qualsiasi) è più alta, ovvero di attribuire una o più regioni più probabili come origini del soggetto o della traccia. In particolare i marcatori del cromosoma Y ereditati nella linea paterna consentono la ricostruzione della storia naturale sulla base delle mutazioni via via acquisite. (permettendo di ipotizzare anche il tracciato territoriale o geografico del cammino percorso dai nostri avi) L'identificazione di sotto-aplogruppi (che fanno riferimento alla variazione della regione non ricombinante del cromosoma Y), la definizione della loro distribuzione geografica e la quantificazione della loro variazione interna, possono dare importanti informazioni sui processi migratori antichi e recenti e su eventi demografici che, avendo lasciato tracce nella struttura genetica delle popolazioni moderne, ce ne raccontano la storia. L'applicazione web sviluppata, chiamata Y-nvestigation, permette, tramite la costruzione di apposite banche dati, di raccogliere informazioni di tipo biologico su tale cromosoma, combinare tali informazioni sul genoma con i relativi dati geografici, esplorare quindi la variazione genetica e la distribuzione geografica dei tipi di cromosomi Y tramite la visualizzazione di mappe principalmente dello spazio eurasiatico.
FOSS4G-IT 2018 Software e Dati Geografici Free e Open Source
Dipartimento di Scienze dell'Antichità dell'Università di Roma La Sapienza
2018
Università di Roma La Sapienza, Associazione Italiana per l'Informazione Geografica Libera (GFOSS.it), Wikimedia Italia
Rilevanza nazionale
contributo
20-feb-2018
Settore INF/01 - Informatica
Settore ING-INF/06 - Bioingegneria Elettronica e Informatica
Italian
GIS, Geographical Information System, cromosoma Y, Database Biologici, Bioinformatica, antropologia
Intervento a convegno
Petricone, D., Novelletto, A., Vigliano, L. (2018). Y-nvestigation: applicazione per analisi geografica della variabilità del cromosoma Y. ??????? it.cilea.surplus.oa.citation.tipologie.CitationProceedings.prensentedAt ??????? FOSS4G-IT 2018 Software e Dati Geografici Free e Open Source, Dipartimento di Scienze dell'Antichità dell'Università di Roma La Sapienza.
Petricone, D; Novelletto, A; Vigliano, L
File in questo prodotto:
File Dimensione Formato  
Poster_presentato_piccolo.pdf

accesso aperto

Descrizione: poster presentato
Licenza: Non specificato
Dimensione 2.74 MB
Formato Adobe PDF
2.74 MB Adobe PDF Visualizza/Apri

I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/2108/193481
Citazioni
  • ???jsp.display-item.citation.pmc??? ND
  • Scopus ND
  • ???jsp.display-item.citation.isi??? ND
social impact