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: SARS-CoV-2 infection is benign in most individuals but, in around 10% of cases, it triggers hypoxaemic COVID-19 pneumonia, which leads to critical illness in around 3% of cases. The ensuing risk of death (approximately 1% across age and gender) doubles every five years from childhood onwards and is around 1.5 times greater in men than in women. Here we review the molecular and cellular determinants of critical COVID-19 pneumonia. Inborn errors of type I interferons (IFNs), including autosomal TLR3 and X-chromosome-linked TLR7 deficiencies, are found in around 1-5% of patients with critical pneumonia under 60 years old, and a lower proportion in older patients. Pre-existing auto-antibodies neutralizing IFNα, IFNβ and/or IFNω, which are more common in men than in women, are found in approximately 15-20% of patients with critical pneumonia over 70 years old, and a lower proportion in younger patients. Thus, at least 15% of cases of critical COVID-19 pneumonia can be explained. The TLR3- and TLR7-dependent production of type I IFNs by respiratory epithelial cells and plasmacytoid dendritic cells, respectively, is essential for host defence against SARS-CoV-2. In ways that can depend on age and sex, insufficient type I IFN immunity in the respiratory tract during the first few days of infection may account for the spread of the virus, leading to pulmonary and systemic inflammation.
Zhang, Q., Bastard, P., Karbuz, A., Gervais, A., Tayoun, A.a., Aiuti, A., et al. (2022). Human genetic and immunological determinants of critical COVID-19 pneumonia. NATURE, 603(7902), 587-598 [10.1038/s41586-022-04447-0].
Human genetic and immunological determinants of critical COVID-19 pneumonia
Zhang Q.;Bastard P.;Karbuz A.;Gervais A.;Tayoun A. A.;Aiuti A.;Belot A.;Bolze A.;Gaudet A.;Bondarenko A.;Spaan A. N.;Guennoun A.;Arias A. A.;Planas A. M.;Sediva A.;Shcherbina A.;Neehus A. -L.;Puel A.;Froidure A.;Novelli A.;Parlakay A. O.;Pujol A.;Yahsi A.;Gulhan B.;Bigio B.;Boisson B.;Drolet B. A.;Franco C. A. A.;Flores C.;Rodriguez-Gallego C.;Prando C.;Biggs C. M.;Luyt C. -E.;Dalgard C. L.;O'Farrelly C.;Matuozzo D.;Dalmau D.;Perlin D. S.;Mansouri D.;van de Beek D.;Vinh D. C.;Dominguez-Garrido E.;Hsieh E. W. Y.;Erdeniz E. H.;Jouanguy E.;Sevketoglu E.;Talouarn E.;Quiros-Roldan E.;Andreakos E.;Husebye E.;Alsohime F.;Haerynck F.;Casari G.;Novelli G.;Aytekin G.;Morelle G.;Alkan G.;Bayhan G. I.;Feldman H. B.;Su H. C.;von Bernuth H.;Resnick I.;Bustos I.;Meyts I.;Migeotte I.;Tancevski I.;Bustamantem J.;Fellay J.;El Baghdadi J.;Martinez-Picado J.;Casanova J. -L.;Rosain J.;Manry J.;Chen J.;Christodoulou J.;Bohlen J.;Franco J. L.;Li J.;Anaya J. M.;Rojas J.;Ye J.;Uddin K. M. F.;Yasar K. K.;Kisand K.;Okamoto K.;Chaibi K.;Mironska K.;Marodi L.;Abel L.;Renia L.;Lorenzo L.;Hammarstrom L.;Ng L. F. P.;Quintana-Murci L.;Erazo L. V.;Notarangelo L. D.;Reyes L. F.;Allende L. M.;Imberti L.;Renkilaraj M. R. L. M.;Moncada-Velez M.;Materna M.;Anderson M. S.;Gut M.;Chbihi M.;Ogishi M.;Emiroglu M.;Seppanen M. R. J.;Uddin M. J.;Shahrooei M.;Alexander N.;Hatipoglu N.;Marr N.;Akcay N.;Boyarchuk O.;Slaby O.;Akcan O. M.;Zhang P.;Soler-Palacin P.;Gregersen P. K.;Brodin P.;Garcon P.;Morange P. -E.;Pan-Hammarstrom Q.;Zhou Q.;Philippot Q.;Halwani R.;de Diego R. P.;Levy R.;Yang R.;Oz S. K. T.;Muhsen S. A.;Kanik-Yuksek S.;Espinosa-Padilla S.;Ramaswamy S.;Okada S.;Bozdemir S. E.;Aytekin S. E.;Karabela S. N.;Keles S.;Senoglu S.;Zhang S. -Y.;Duvlis S.;Constantinescu S. N.;Boisson-Dupuis S.;Turvey S. E.;Tangye S. G.;Asano T.;Ozcelik T.;Le Voyer T.;Maniatis T.;Morio T.;Mogensen T. H.;Sancho-Shimizu V.;Beziat V.;Solanich X.;Bryceson Y.;Lau Y. -L.;Itan Y.;Cobat A.;Casanova J. -L.
2022-03-01
Abstract
: SARS-CoV-2 infection is benign in most individuals but, in around 10% of cases, it triggers hypoxaemic COVID-19 pneumonia, which leads to critical illness in around 3% of cases. The ensuing risk of death (approximately 1% across age and gender) doubles every five years from childhood onwards and is around 1.5 times greater in men than in women. Here we review the molecular and cellular determinants of critical COVID-19 pneumonia. Inborn errors of type I interferons (IFNs), including autosomal TLR3 and X-chromosome-linked TLR7 deficiencies, are found in around 1-5% of patients with critical pneumonia under 60 years old, and a lower proportion in older patients. Pre-existing auto-antibodies neutralizing IFNα, IFNβ and/or IFNω, which are more common in men than in women, are found in approximately 15-20% of patients with critical pneumonia over 70 years old, and a lower proportion in younger patients. Thus, at least 15% of cases of critical COVID-19 pneumonia can be explained. The TLR3- and TLR7-dependent production of type I IFNs by respiratory epithelial cells and plasmacytoid dendritic cells, respectively, is essential for host defence against SARS-CoV-2. In ways that can depend on age and sex, insufficient type I IFN immunity in the respiratory tract during the first few days of infection may account for the spread of the virus, leading to pulmonary and systemic inflammation.
Zhang, Q., Bastard, P., Karbuz, A., Gervais, A., Tayoun, A.a., Aiuti, A., et al. (2022). Human genetic and immunological determinants of critical COVID-19 pneumonia. NATURE, 603(7902), 587-598 [10.1038/s41586-022-04447-0].
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
