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IRIS
The unfolded- and folded-state infrared (IR) spectra of peptides studied to date show a common pattern, i.e., the amide I peak of the unfolded state is typically shifted toward higher frequencies with respect to the folded peak. Here, we study by means of a theoretical-computational method, the Perturbed Matrix Method (PMM), the IR spectra in the amide I region of two beta-hairpin peptides. The computed spectra are in good agreement with the experimental ones, thus providing an explanation of the physical origin underlying the differences of the unfolded- and folded-state spectra.
Daidone, I., Aschi, M., Zanetti Polzi, L., Di Nola, A., Amadei, A. (2010). On the origin of IR spectral changes upon folding. CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 488(4-6), 213-218 [10.1016/j.cplett.2010.02.020].
On the origin of IR spectral changes upon folding
Daidone, I;Aschi, M;Zanetti Polzi, L;Di Nola, A;AMADEI, ANDREA
2010-01-01
Abstract
The unfolded- and folded-state infrared (IR) spectra of peptides studied to date show a common pattern, i.e., the amide I peak of the unfolded state is typically shifted toward higher frequencies with respect to the folded peak. Here, we study by means of a theoretical-computational method, the Perturbed Matrix Method (PMM), the IR spectra in the amide I region of two beta-hairpin peptides. The computed spectra are in good agreement with the experimental ones, thus providing an explanation of the physical origin underlying the differences of the unfolded- and folded-state spectra.
Daidone, I., Aschi, M., Zanetti Polzi, L., Di Nola, A., Amadei, A. (2010). On the origin of IR spectral changes upon folding. CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 488(4-6), 213-218 [10.1016/j.cplett.2010.02.020].
Daidone, I; Aschi, M; Zanetti Polzi, L; Di Nola, A; Amadei, A
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.